（一）開放運行情況
自2002年以來，實驗中心每天8:00～17:00開放，每周開放7天，每年平均開放時間280天，實驗運行采用三種方式：一是計劃實驗，是學生在指定時間指定地點進行的實驗；二是開放實驗室，學生自擬題目任意出入，中心為學生提供一個任意發揮的實驗環境；三是預約實驗，是需要提前準備或在開放時間之外的實驗。幾年來的實踐證明，這種運行方式深受學生歡迎。
（二）管理制度
學校、實驗中心制定了各項規章制度，建立了校、院兩級考核評審制度，強化了標準化管理、檔案管理，自2003年以來就實行了學生實驗報告歸檔管理制。
值班人員每天寫值班記錄，記錄實驗中心所有情況。實驗指導教師填寫教學記錄，每天登記所有實驗室儀器設備的運行狀況，保證儀器設備的配套性、完好率和利用率。
（三）考評辦法
中心采用年度考核和兩年聘期考核相結合的方式，年度考核由學校布置，學院負責，進行聘任考核；聘期考核由學校組織，統一進行；學校建立了有效的工作競爭機制，采取晉職晉級、評優、表彰、獎勵等有效手段，調動實驗教師的工作積極性；對出現重大教學事故的教師和年度考核不合格的教師，暫停晉職晉級資格。中心還不定期地對實驗課進行檢查和對實驗報告進行抽查，抽查情況與年終考核掛鉤。
（四）質量保證體系
實驗教學過程中，值班人員通過監控系統不斷巡視實驗教學情況，在值班時間內他具有實驗中心負責人的權利和責任，并對所有工作內容負責，實驗中心所有專兼職人員必須服從值班人員的工作安排、調遣和監督。無論出現何種問題，值班人員承擔第一責任，這樣從運行機制上保證了每一位專職人員都有機會接觸和掌握實驗室的全部工作內容，培養了責任心，鍛煉了獨立工作能力，提升了實驗室管理隊伍的業務素質。現在實驗室的每一位同志都具備了獨立調度、安排實驗室正常工作的能力，形成了誰接班先看值班記錄的工作習慣。
（五）運行經費保障
學校提供必要的財力、物力支持中心的建設和運轉，每年下撥中心維持費，負責實驗設備的維護和維修。實驗教學中心建立了日常教學運行費的使用管理辦法，所有教學經費實行專款專用，有力地保證了本中心實驗教學工作的正常運轉。
